Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PUM3Q15397 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PUM3Q15397 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PUM3Q15397 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PUM3Q15397 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PUM3Q15397 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PUM3Q15397 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PUM3Q15397 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
PUM3Q15397 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PUM3Q15397 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PUM3Q15397 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PUM3Q15397 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PUM3Q15397 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PUM3Q15397 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PUM3Q15397 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.73□□□□□ -2.29
PUM3Q15397 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PUM3Q15397 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PUM3Q15397 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PUM3Q15397 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PUM3Q15397 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PUM3Q15397 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PUM3Q15397 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PUM3Q15397 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PUM3Q15397 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PUM3Q15397 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PUM3Q15397 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PUM3Q15397 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PUM3Q15397 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PUM3Q15397 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PUM3Q15397 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PUM3Q15397 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PUM3Q15397 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PUM3Q15397 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PUM3Q15397 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PUM3Q15397 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PUM3Q15397 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PUM3Q15397 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PUM3Q15397 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PUM3Q15397 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PUM3Q15397 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PUM3Q15397 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PUM3Q15397 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PUM3Q15397 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PUM3Q15397 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PUM3Q15397 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PUM3Q15397 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PUM3Q15397 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PUM3Q15397 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PUM3Q15397 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PUM3Q15397 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PUM3Q15397 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PUM3Q15397 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PUM3Q15397 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PUM3Q15397 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PUM3Q15397 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PUM3Q15397 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.8 ms