Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.84□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TTF1Q15361 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TTF1Q15361 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TTF1Q15361 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TTF1Q15361 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TTF1Q15361 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TTF1Q15361 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TTF1Q15361 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TTF1Q15361 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TTF1Q15361 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TTF1Q15361 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TTF1Q15361 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TTF1Q15361 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TTF1Q15361 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
TTF1Q15361 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TTF1Q15361 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TTF1Q15361 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TTF1Q15361 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TTF1Q15361 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TTF1Q15361 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TTF1Q15361 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TTF1Q15361 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TTF1Q15361 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TTF1Q15361 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TTF1Q15361 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TTF1Q15361 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TTF1Q15361 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TTF1Q15361 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TTF1Q15361 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TTF1Q15361 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TTF1Q15361 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TTF1Q15361 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TTF1Q15361 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TTF1Q15361 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TTF1Q15361 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TTF1Q15361 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TTF1Q15361 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TTF1Q15361 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TTF1Q15361 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TTF1Q15361 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TTF1Q15361 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TTF1Q15361 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TTF1Q15361 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TTF1Q15361 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TTF1Q15361 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TTF1Q15361 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TTF1Q15361 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TTF1Q15361 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TTF1Q15361 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
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TTF1Q15361 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TTF1Q15361 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TTF1Q15361 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TTF1Q15361 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TTF1Q15361 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TTF1Q15361 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TTF1Q15361 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TTF1Q15361 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TTF1Q15361 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TTF1Q15361 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TTF1Q15361 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TTF1Q15361 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TTF1Q15361 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TTF1Q15361 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TTF1Q15361 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TTF1Q15361 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TTF1Q15361 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
TTF1Q15361 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TTF1Q15361 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TTF1Q15361 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TTF1Q15361 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TTF1Q15361 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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