Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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TNFAIP1Q13829 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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TNFAIP1Q13829 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
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TNFAIP1Q13829 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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TNFAIP1Q13829 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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TNFAIP1Q13829 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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TNFAIP1Q13829 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TNFAIP1Q13829 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
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TNFAIP1Q13829 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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TNFAIP1Q13829 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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