Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SQSTM1Q13501 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
SQSTM1Q13501 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SQSTM1Q13501 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SQSTM1Q13501 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SQSTM1Q13501 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SQSTM1Q13501 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SQSTM1Q13501 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SQSTM1Q13501 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SQSTM1Q13501 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SQSTM1Q13501 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SQSTM1Q13501 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SQSTM1Q13501 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SQSTM1Q13501 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SQSTM1Q13501 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SQSTM1Q13501 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SQSTM1Q13501 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SQSTM1Q13501 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SQSTM1Q13501 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SQSTM1Q13501 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SQSTM1Q13501 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SQSTM1Q13501 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SQSTM1Q13501 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SQSTM1Q13501 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SQSTM1Q13501 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SQSTM1Q13501 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SQSTM1Q13501 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SQSTM1Q13501 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SQSTM1Q13501 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SQSTM1Q13501 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SQSTM1Q13501 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SQSTM1Q13501 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SQSTM1Q13501 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SQSTM1Q13501 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SQSTM1Q13501 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SQSTM1Q13501 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SQSTM1Q13501 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SQSTM1Q13501 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SQSTM1Q13501 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SQSTM1Q13501 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SQSTM1Q13501 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SQSTM1Q13501 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SQSTM1Q13501 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SQSTM1Q13501 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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