Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PMS2P3Q13401 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PMS2P3Q13401 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PMS2P3Q13401 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PMS2P3Q13401 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PMS2P3Q13401 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PMS2P3Q13401 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PMS2P3Q13401 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PMS2P3Q13401 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PMS2P3Q13401 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PMS2P3Q13401 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PMS2P3Q13401 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PMS2P3Q13401 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PMS2P3Q13401 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PMS2P3Q13401 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PMS2P3Q13401 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PMS2P3Q13401 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PMS2P3Q13401 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PMS2P3Q13401 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PMS2P3Q13401 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PMS2P3Q13401 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PMS2P3Q13401 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PMS2P3Q13401 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PMS2P3Q13401 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PMS2P3Q13401 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PMS2P3Q13401 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PMS2P3Q13401 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PMS2P3Q13401 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-1.64□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PMS2P3Q13401 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PMS2P3Q13401 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PMS2P3Q13401 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PMS2P3Q13401 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PMS2P3Q13401 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PMS2P3Q13401 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PMS2P3Q13401 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PMS2P3Q13401 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PMS2P3Q13401 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PMS2P3Q13401 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PMS2P3Q13401 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-1.66□□□□□ -2.68
PMS2P3Q13401 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PMS2P3Q13401 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PMS2P3Q13401 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PMS2P3Q13401 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PMS2P3Q13401 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PMS2P3Q13401 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PMS2P3Q13401 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PMS2P3Q13401 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC-1.67□□□□□ -2.68
PMS2P3Q13401 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PMS2P3Q13401 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PMS2P3Q13401 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.4 ms