Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PDE3BQ13370 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PDE3BQ13370 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
PDE3BQ13370 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE3BQ13370 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE3BQ13370 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE3BQ13370 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE3BQ13370 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE3BQ13370 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE3BQ13370 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE3BQ13370 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE3BQ13370 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE3BQ13370 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE3BQ13370 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE3BQ13370 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE3BQ13370 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE3BQ13370 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE3BQ13370 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE3BQ13370 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE3BQ13370 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE3BQ13370 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE3BQ13370 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE3BQ13370 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE3BQ13370 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE3BQ13370 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE3BQ13370 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE3BQ13370 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE3BQ13370 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE3BQ13370 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE3BQ13370 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE3BQ13370 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE3BQ13370 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE3BQ13370 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PDE3BQ13370 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE3BQ13370 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE3BQ13370 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE3BQ13370 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE3BQ13370 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217.2 ms