Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
NR1H3Q13133 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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