Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXC1Q12948 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXC1Q12948 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
FOXC1Q12948 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXC1Q12948 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
FOXC1Q12948 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
FOXC1Q12948 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
FOXC1Q12948 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXC1Q12948 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXC1Q12948 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXC1Q12948 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXC1Q12948 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXC1Q12948 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXC1Q12948 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXC1Q12948 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXC1Q12948 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXC1Q12948 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXC1Q12948 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXC1Q12948 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
FOXC1Q12948 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXC1Q12948 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXC1Q12948 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXC1Q12948 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXC1Q12948 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
FOXC1Q12948 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXC1Q12948 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXC1Q12948 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXC1Q12948 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXC1Q12948 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXC1Q12948 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXC1Q12948 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXC1Q12948 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
FOXC1Q12948 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
FOXC1Q12948 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
FOXC1Q12948 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
FOXC1Q12948 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXC1Q12948 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXC1Q12948 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
FOXC1Q12948 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXC1Q12948 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
FOXC1Q12948 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXC1Q12948 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXC1Q12948 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
FOXC1Q12948 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
FOXC1Q12948 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
FOXC1Q12948 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXC1Q12948 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXC1Q12948 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXC1Q12948 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXC1Q12948 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXC1Q12948 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXC1Q12948 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXC1Q12948 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXC1Q12948 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXC1Q12948 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXC1Q12948 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXC1Q12948 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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