Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
FOXF1Q12946 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
FOXF1Q12946 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
FOXF1Q12946 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
FOXF1Q12946 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
FOXF1Q12946 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
FOXF1Q12946 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
FOXF1Q12946 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
FOXF1Q12946 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
FOXF1Q12946 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
FOXF1Q12946 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
FOXF1Q12946 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
FOXF1Q12946 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
FOXF1Q12946 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
FOXF1Q12946 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
FOXF1Q12946 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.6 ms