Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CGGBP1Q9UFW8 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CGGBP1Q9UFW8 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
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