Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GGA3Q9NZ52 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GGA3Q9NZ52 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GGA3Q9NZ52 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GGA3Q9NZ52 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GGA3Q9NZ52 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GGA3Q9NZ52 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GGA3Q9NZ52 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GGA3Q9NZ52 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GGA3Q9NZ52 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GGA3Q9NZ52 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GGA3Q9NZ52 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GGA3Q9NZ52 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GGA3Q9NZ52 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GGA3Q9NZ52 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GGA3Q9NZ52 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GGA3Q9NZ52 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GGA3Q9NZ52 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GGA3Q9NZ52 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GGA3Q9NZ52 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GGA3Q9NZ52 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GGA3Q9NZ52 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GGA3Q9NZ52 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GGA3Q9NZ52 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
GGA3Q9NZ52 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
GGA3Q9NZ52 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
GGA3Q9NZ52 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
GGA3Q9NZ52 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
GGA3Q9NZ52 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
GGA3Q9NZ52 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
GGA3Q9NZ52 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
GGA3Q9NZ52 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
GGA3Q9NZ52 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
GGA3Q9NZ52 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GGA3Q9NZ52 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GGA3Q9NZ52 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GGA3Q9NZ52 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GGA3Q9NZ52 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
GGA3Q9NZ52 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
GGA3Q9NZ52 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
GGA3Q9NZ52 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
GGA3Q9NZ52 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
GGA3Q9NZ52 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
GGA3Q9NZ52 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
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