Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ZBED3Q96IU2 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ZBED3Q96IU2 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ZBED3Q96IU2 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ZBED3Q96IU2 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ZBED3Q96IU2 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ZBED3Q96IU2 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ZBED3Q96IU2 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ZBED3Q96IU2 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ZBED3Q96IU2 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ZBED3Q96IU2 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ZBED3Q96IU2 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ZBED3Q96IU2 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ZBED3Q96IU2 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ZBED3Q96IU2 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ZBED3Q96IU2 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ZBED3Q96IU2 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ZBED3Q96IU2 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ZBED3Q96IU2 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ZBED3Q96IU2 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ZBED3Q96IU2 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ZBED3Q96IU2 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ZBED3Q96IU2 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ZBED3Q96IU2 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ZBED3Q96IU2 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ZBED3Q96IU2 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ZBED3Q96IU2 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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ZBED3Q96IU2 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ZBED3Q96IU2 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ZBED3Q96IU2 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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ZBED3Q96IU2 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
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ZBED3Q96IU2 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
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ZBED3Q96IU2 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ZBED3Q96IU2 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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ZBED3Q96IU2 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ZBED3Q96IU2 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ZBED3Q96IU2 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ZBED3Q96IU2 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ZBED3Q96IU2 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ZBED3Q96IU2 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
ZBED3Q96IU2 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ZBED3Q96IU2 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
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