Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUF6

LINC00336, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00336, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00336Q6ZUF6 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.23□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
LINC00336Q6ZUF6 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
LINC00336Q6ZUF6 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
LINC00336Q6ZUF6 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 226.7 ms