Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
UBR3Q6ZT12 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
UBR3Q6ZT12 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
UBR3Q6ZT12 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
UBR3Q6ZT12 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
UBR3Q6ZT12 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
UBR3Q6ZT12 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
UBR3Q6ZT12 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
UBR3Q6ZT12 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
UBR3Q6ZT12 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
UBR3Q6ZT12 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
UBR3Q6ZT12 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
UBR3Q6ZT12 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
UBR3Q6ZT12 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
UBR3Q6ZT12 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
UBR3Q6ZT12 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
UBR3Q6ZT12 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
UBR3Q6ZT12 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
UBR3Q6ZT12 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
UBR3Q6ZT12 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
UBR3Q6ZT12 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
UBR3Q6ZT12 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
UBR3Q6ZT12 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
UBR3Q6ZT12 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
UBR3Q6ZT12 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
UBR3Q6ZT12 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
UBR3Q6ZT12 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
UBR3Q6ZT12 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
UBR3Q6ZT12 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC-2.59□□□□□ -2.82
UBR3Q6ZT12 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
UBR3Q6ZT12 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
UBR3Q6ZT12 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC-2.6□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC-2.63□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC-2.64□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-2.65□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.8 ms