Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CCDC96Q2M329 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CCDC96Q2M329 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CCDC96Q2M329 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CCDC96Q2M329 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CCDC96Q2M329 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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CCDC96Q2M329 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CCDC96Q2M329 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CCDC96Q2M329 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CCDC96Q2M329 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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CCDC96Q2M329 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CCDC96Q2M329 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CCDC96Q2M329 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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CCDC96Q2M329 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CCDC96Q2M329 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CCDC96Q2M329 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CCDC96Q2M329 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CCDC96Q2M329 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CCDC96Q2M329 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CCDC96Q2M329 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CCDC96Q2M329 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CCDC96Q2M329 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CCDC96Q2M329 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CCDC96Q2M329 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CCDC96Q2M329 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CCDC96Q2M329 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CCDC96Q2M329 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CCDC96Q2M329 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CCDC96Q2M329 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CCDC96Q2M329 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CCDC96Q2M329 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CCDC96Q2M329 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CCDC96Q2M329 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CCDC96Q2M329 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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CCDC96Q2M329 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CCDC96Q2M329 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CCDC96Q2M329 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CCDC96Q2M329 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CCDC96Q2M329 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CCDC96Q2M329 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CCDC96Q2M329 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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CCDC96Q2M329 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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CCDC96Q2M329 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
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CCDC96Q2M329 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CCDC96Q2M329 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CCDC96Q2M329 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
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CCDC96Q2M329 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CCDC96Q2M329 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CCDC96Q2M329 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CCDC96Q2M329 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CCDC96Q2M329 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CCDC96Q2M329 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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CCDC96Q2M329 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CCDC96Q2M329 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CCDC96Q2M329 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CCDC96Q2M329 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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CCDC96Q2M329 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CCDC96Q2M329 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CCDC96Q2M329 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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