Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
COL24A1Q17RW2 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.17□□□□□ -2.6
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COL24A1Q17RW2 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
COL24A1Q17RW2 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
COL24A1Q17RW2 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
COL24A1Q17RW2 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
COL24A1Q17RW2 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
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COL24A1Q17RW2 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
COL24A1Q17RW2 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
COL24A1Q17RW2 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
COL24A1Q17RW2 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
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COL24A1Q17RW2 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
COL24A1Q17RW2 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
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COL24A1Q17RW2 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
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COL24A1Q17RW2 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
COL24A1Q17RW2 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
COL24A1Q17RW2 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
COL24A1Q17RW2 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-1.2□□□□□ -2.6
COL24A1Q17RW2 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
COL24A1Q17RW2 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
COL24A1Q17RW2 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
COL24A1Q17RW2 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
COL24A1Q17RW2 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
COL24A1Q17RW2 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
COL24A1Q17RW2 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
COL24A1Q17RW2 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
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COL24A1Q17RW2 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
COL24A1Q17RW2 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
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COL24A1Q17RW2 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
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COL24A1Q17RW2 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
COL24A1Q17RW2 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
COL24A1Q17RW2 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
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COL24A1Q17RW2 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
COL24A1Q17RW2 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
COL24A1Q17RW2 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
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COL24A1Q17RW2 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
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COL24A1Q17RW2 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
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COL24A1Q17RW2 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
COL24A1Q17RW2 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
COL24A1Q17RW2 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
COL24A1Q17RW2 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
COL24A1Q17RW2 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
COL24A1Q17RW2 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
COL24A1Q17RW2 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
COL24A1Q17RW2 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
COL24A1Q17RW2 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
COL24A1Q17RW2 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
COL24A1Q17RW2 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
COL24A1Q17RW2 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
COL24A1Q17RW2 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
COL24A1Q17RW2 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
COL24A1Q17RW2 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
COL24A1Q17RW2 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
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