Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
CCDC142Q17RM4 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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