Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
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