Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-1.26□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
VAMP3Q15836 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
VAMP3Q15836 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
VAMP3Q15836 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
VAMP3Q15836 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
VAMP3Q15836 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
VAMP3Q15836 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
VAMP3Q15836 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
VAMP3Q15836 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
VAMP3Q15836 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
VAMP3Q15836 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
VAMP3Q15836 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
VAMP3Q15836 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
VAMP3Q15836 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
VAMP3Q15836 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
VAMP3Q15836 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
VAMP3Q15836 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
VAMP3Q15836 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
VAMP3Q15836 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
VAMP3Q15836 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
VAMP3Q15836 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
VAMP3Q15836 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
VAMP3Q15836 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
VAMP3Q15836 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
VAMP3Q15836 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 244.6 ms