Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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SNX17Q15036 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
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SNX17Q15036 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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SNX17Q15036 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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SNX17Q15036 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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SNX17Q15036 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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SNX17Q15036 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
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SNX17Q15036 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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SNX17Q15036 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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SNX17Q15036 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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SNX17Q15036 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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SNX17Q15036 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
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SNX17Q15036 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SNX17Q15036 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SNX17Q15036 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SNX17Q15036 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SNX17Q15036 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SNX17Q15036 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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SNX17Q15036 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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SNX17Q15036 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNX17Q15036 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNX17Q15036 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNX17Q15036 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNX17Q15036 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNX17Q15036 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
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