Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
DDX39BQ13838 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
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