Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPREP23469 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPREP23469 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPREP23469 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPREP23469 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPREP23469 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPREP23469 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPREP23469 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPREP23469 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPREP23469 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPREP23469 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPREP23469 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPREP23469 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPREP23469 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPREP23469 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPREP23469 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPREP23469 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPREP23469 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PTPREP23469 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPREP23469 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPREP23469 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPREP23469 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPREP23469 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPREP23469 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPREP23469 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPREP23469 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPREP23469 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPREP23469 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPREP23469 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PTPREP23469 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PTPREP23469 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPREP23469 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPREP23469 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPREP23469 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPREP23469 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPREP23469 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPREP23469 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPREP23469 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPREP23469 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPREP23469 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPREP23469 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPREP23469 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPREP23469 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPREP23469 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPREP23469 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
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PTPREP23469 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPREP23469 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPREP23469 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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PTPREP23469 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPREP23469 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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PTPREP23469 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPREP23469 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPREP23469 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPREP23469 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
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PTPREP23469 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPREP23469 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPREP23469 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPREP23469 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPREP23469 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPREP23469 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPREP23469 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPREP23469 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPREP23469 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPREP23469 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPREP23469 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPREP23469 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPREP23469 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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