Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNX13Q9Y5W8 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNX13Q9Y5W8 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNX13Q9Y5W8 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNX13Q9Y5W8 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNX13Q9Y5W8 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNX13Q9Y5W8 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNX13Q9Y5W8 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SNX13Q9Y5W8 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SNX13Q9Y5W8 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SNX13Q9Y5W8 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SNX13Q9Y5W8 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SNX13Q9Y5W8 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SNX13Q9Y5W8 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SNX13Q9Y5W8 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SNX13Q9Y5W8 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SNX13Q9Y5W8 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SNX13Q9Y5W8 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SNX13Q9Y5W8 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SNX13Q9Y5W8 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNX13Q9Y5W8 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNX13Q9Y5W8 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SNX13Q9Y5W8 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SNX13Q9Y5W8 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SNX13Q9Y5W8 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SNX13Q9Y5W8 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SNX13Q9Y5W8 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SNX13Q9Y5W8 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SNX13Q9Y5W8 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SNX13Q9Y5W8 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SNX13Q9Y5W8 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 242.7 ms