Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SH3BP1Q9Y3L3 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SH3BP1Q9Y3L3 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SH3BP1Q9Y3L3 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SH3BP1Q9Y3L3 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SH3BP1Q9Y3L3 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SH3BP1Q9Y3L3 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SH3BP1Q9Y3L3 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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