Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB4

CDH9, Cadherin-9, humanhuman

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Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH9Q9ULB4 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.12□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CDH9Q9ULB4 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CDH9Q9ULB4 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CDH9Q9ULB4 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CDH9Q9ULB4 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CDH9Q9ULB4 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CDH9Q9ULB4 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CDH9Q9ULB4 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CDH9Q9ULB4 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CDH9Q9ULB4 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CDH9Q9ULB4 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CDH9Q9ULB4 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CDH9Q9ULB4 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CDH9Q9ULB4 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CDH9Q9ULB4 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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