Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZP8

C1RL, Complement C1r subcomponent-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RLQ9NZP8 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
C1RLQ9NZP8 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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