Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ECM1Q16610 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ECM1Q16610 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ECM1Q16610 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ECM1Q16610 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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ECM1Q16610 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ECM1Q16610 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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