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Protein–RNA interactions for Protein: Q14563
SEMA3A, Semaphorin-3A, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
SEMA3A
Q14563
RNY1P10-201
ENST00000363268
113 nt
BASIC
1.47
□□□□□ -2.17
SEMA3A
Q14563
RNU1-42P-201
ENST00000364033
160 nt
BASIC
1.47
□□□□□ -2.17
SEMA3A
Q14563
RNU6-60P-201
ENST00000364792
103 nt
BASIC
1.47
□□□□□ -2.17
SEMA3A
Q14563
MIR150-201
ENST00000385048
84 nt
BASIC
1.47
□□□□□ -2.17
SEMA3A
Q14563
MIR577-201
ENST00000385196
96 nt
BASIC
1.47
□□□□□ -2.17
SEMA3A
Q14563
MIR759-201
ENST00000390224
91 nt
BASIC
1.47
□□□□□ -2.17
SEMA3A
Q14563
RNU6-679P-201
ENST00000391003
106 nt
BASIC
1.47
□□□□□ -2.17
SEMA3A
Q14563
SNORA67.5-201
ENST00000391036
107 nt
BASIC
1.47
□□□□□ -2.17
SEMA3A
Q14563
RPS3AP1-201
ENST00000413190
320 nt
BASIC
1.47
□□□□□ -2.17
SEMA3A
Q14563
AC090844.1-201
ENST00000422019
156 nt
BASIC
1.47
□□□□□ -2.17
SEMA3A
Q14563
RPS27P16-201
ENST00000425758
201 nt
BASIC
1.47
□□□□□ -2.17
SEMA3A
Q14563
RNU7-113P-201
ENST00000459273
62 nt
BASIC
1.47
□□□□□ -2.17
SEMA3A
Q14563
RNU6-947P-201
ENST00000516264
106 nt
BASIC
1.47
□□□□□ -2.17
SEMA3A
Q14563
RNU6-762P-201
ENST00000517107
102 nt
BASIC
1.47
□□□□□ -2.17
SEMA3A
Q14563
AP003174.1-201
ENST00000306533
376 nt
TSL 2
BASIC
1.46
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
SNORD115-2-201
ENST00000362842
82 nt
BASIC
1.46
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
RNU6-1099P-201
ENST00000363533
107 nt
BASIC
1.46
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
SNORD73B-201
ENST00000364394
72 nt
BASIC
1.46
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
SNORD115-20-201
ENST00000365099
82 nt
BASIC
1.46
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
SNORA32-201
ENST00000384072
121 nt
BASIC
1.46
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
RNU6-342P-201
ENST00000384521
104 nt
BASIC
1.46
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
MIR520C-201
ENST00000385005
87 nt
BASIC
1.46
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
RNU6-1307P-201
ENST00000391012
103 nt
BASIC
1.46
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
AL354695.1-201
ENST00000427935
228 nt
BASIC
1.46
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
RNU7-73P-201
ENST00000458743
63 nt
BASIC
1.46
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
RNU7-43P-201
ENST00000516554
64 nt
BASIC
1.46
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
MIR8055-201
ENST00000610739
97 nt
BASIC
1.46
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
TRAJ36-201
ENST00000614481
58 nt
APPRIS P1
BASIC
1.46
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
AC091304.10-201
ENST00000641554
121 nt
BASIC
1.46
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.78-201
ENST00000362970
110 nt
BASIC
1.45
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.360-201
ENST00000365512
102 nt
BASIC
1.45
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
SNORA67.6-201
ENST00000391093
99 nt
BASIC
1.45
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
RNU4-69P-201
ENST00000410677
143 nt
BASIC
1.45
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
MTATP8P2-201
ENST00000435212
202 nt
BASIC
1.45
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
RNU7-41P-201
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61 nt
BASIC
1.45
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
RNU6-795P-201
ENST00000516323
103 nt
BASIC
1.45
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
SNORA40.13-201
ENST00000516379
120 nt
BASIC
1.45
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
RNA5SP61-201
ENST00000516453
100 nt
BASIC
1.45
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
RNA5SP33-201
ENST00000516687
98 nt
BASIC
1.45
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
SNORA31.24-201
ENST00000517232
57 nt
BASIC
1.45
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
SLC8A1-AS1-230
ENST00000627538
212 nt
TSL 5
BASIC
1.45
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
RNU6-363P-201
ENST00000362895
105 nt
BASIC
1.44
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
RNY3P2-201
ENST00000362918
102 nt
BASIC
1.44
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
RNU4-67P-201
ENST00000364569
141 nt
BASIC
1.44
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
SNORA1.1-201
ENST00000364671
133 nt
BASIC
1.44
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
RNU6-294P-201
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102 nt
BASIC
1.44
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.342-201
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113 nt
BASIC
1.44
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.388-201
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113 nt
BASIC
1.44
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.466-201
ENST00000384294
113 nt
BASIC
1.44
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
SNORA7.5-201
ENST00000410672
110 nt
BASIC
1.44
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
RNU6-321P-201
ENST00000410912
106 nt
BASIC
1.44
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
AL135923.1-201
ENST00000413066
196 nt
TSL 3
BASIC
1.44
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
RNU7-53P-201
ENST00000516705
60 nt
BASIC
1.44
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
IGHVII-40-1-201
ENST00000517316
58 nt
BASIC
1.44
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
MIR548AO-201
ENST00000579992
96 nt
BASIC
1.44
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
MIR4764-201
ENST00000580680
88 nt
BASIC
1.44
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
AC012531.4-201
ENST00000616509
177 nt
BASIC
1.44
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
MIR8065-201
ENST00000620577
100 nt
BASIC
1.44
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
NPAT-201
ENST00000278612
6117 nt
APPRIS P2
TSL 1 (best)
BASIC
1.43
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.430-201
ENST00000384081
110 nt
BASIC
1.43
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.537-201
ENST00000384626
109 nt
BASIC
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□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.544-201
ENST00000384650
113 nt
BASIC
1.43
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
MIR1912-201
ENST00000410389
80 nt
BASIC
1.43
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
SNORD111.1-201
ENST00000516421
86 nt
BASIC
1.43
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.818-201
ENST00000618813
71 nt
BASIC
1.43
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
MIR7111-201
ENST00000619751
72 nt
BASIC
1.43
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
AC008133.2-201
ENST00000624540
351 nt
BASIC
1.43
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
UBE3A-225
ENST00000636667
5726 nt
TSL 5
BASIC
1.43
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.155-201
ENST00000363632
101 nt
BASIC
1.42
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.247-201
ENST00000364500
92 nt
BASIC
1.42
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
SNORA70.7-201
ENST00000384159
133 nt
BASIC
1.42
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
RNU6-1113P-201
ENST00000384348
107 nt
BASIC
1.42
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
SNORD41-201
ENST00000386967
70 nt
BASIC
1.42
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
TRAJ47-201
ENST00000390490
57 nt
APPRIS P1
BASIC
1.42
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
RNU6-602P-201
ENST00000411155
105 nt
BASIC
1.42
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
BTF3P4-201
ENST00000418852
495 nt
BASIC
1.42
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
snoU13.25-201
ENST00000458945
104 nt
BASIC
1.42
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
DEFB131E-201
ENST00000532329
154 nt
BASIC
1.42
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
AL512310.8-201
ENST00000550183
120 nt
BASIC
1.42
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
MIR3664-201
ENST00000579074
99 nt
BASIC
1.42
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
MALAT1.1-201
ENST00000618249
95 nt
BASIC
1.42
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
CTDSPL2-202
ENST00000558373
4255 nt
TSL 1 (best)
BASIC
1.41
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
RNU6-832P-201
ENST00000363319
107 nt
BASIC
1.41
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.290-201
ENST00000364879
114 nt
BASIC
1.41
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
MIR499A-201
ENST00000384903
122 nt
BASIC
1.41
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
RNU6-733P-201
ENST00000410759
104 nt
BASIC
1.41
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
UBL5P1-201
ENST00000507979
193 nt
BASIC
1.41
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
RNU7-61P-201
ENST00000515897
61 nt
BASIC
1.41
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
SCARNA23-201
ENST00000516060
130 nt
BASIC
1.41
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
SNORA72.7-201
ENST00000516349
94 nt
BASIC
1.41
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
RNU6-521P-201
ENST00000516663
105 nt
BASIC
1.41
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
RN7SKP88-201
ENST00000516847
250 nt
BASIC
1.41
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
RNU6-158P-201
ENST00000517104
100 nt
BASIC
1.41
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
IGLVVI-22-1-201
ENST00000521183
211 nt
BASIC
1.41
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
DNAJC19P9-201
ENST00000555084
351 nt
BASIC
1.41
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
MIR3192-201
ENST00000584920
77 nt
BASIC
1.41
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
AL359821.1-201
ENST00000605519
182 nt
BASIC
1.41
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
7SK.8-201
ENST00000612110
250 nt
BASIC
1.41
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
7SK.11-201
ENST00000615477
250 nt
BASIC
1.41
□□□□□ -2.18
SEMA3A
Q14563
7SK.13-201
ENST00000622040
250 nt
BASIC
1.41
□□□□□ -2.18
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