Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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