Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 269.3 ms