Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
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PTPRAP18433 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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PTPRAP18433 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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PTPRAP18433 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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PTPRAP18433 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRAP18433 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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PTPRAP18433 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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PTPRAP18433 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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PTPRAP18433 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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PTPRAP18433 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
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PTPRAP18433 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRAP18433 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRAP18433 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRAP18433 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRAP18433 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRAP18433 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRAP18433 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRAP18433 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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PTPRAP18433 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRAP18433 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRAP18433 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRAP18433 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRAP18433 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRAP18433 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
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PTPRAP18433 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRAP18433 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRAP18433 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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