Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl27Q99N92 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl27Q99N92 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl27Q99N92 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl27Q99N92 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl27Q99N92 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl27Q99N92 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Mrpl27Q99N92 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Mrpl27Q99N92 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Mrpl27Q99N92 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl27Q99N92 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms