Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SHOC2Q9UQ13 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SHOC2Q9UQ13 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SHOC2Q9UQ13 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SHOC2Q9UQ13 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SHOC2Q9UQ13 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SHOC2Q9UQ13 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SHOC2Q9UQ13 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SHOC2Q9UQ13 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SHOC2Q9UQ13 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SHOC2Q9UQ13 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SHOC2Q9UQ13 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SHOC2Q9UQ13 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SHOC2Q9UQ13 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SHOC2Q9UQ13 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SHOC2Q9UQ13 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SHOC2Q9UQ13 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SHOC2Q9UQ13 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SHOC2Q9UQ13 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SHOC2Q9UQ13 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SHOC2Q9UQ13 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SHOC2Q9UQ13 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SHOC2Q9UQ13 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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