Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TTF1Q15361 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 229.3 ms