Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.09
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COL9A2Q14055 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COL9A2Q14055 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
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COL9A2Q14055 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
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COL9A2Q14055 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
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COL9A2Q14055 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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COL9A2Q14055 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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COL9A2Q14055 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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COL9A2Q14055 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
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COL9A2Q14055 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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