Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
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TRAF3Q13114 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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TRAF3Q13114 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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