Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NPRL3Q12980 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.27□□□□□ -2.37
NPRL3Q12980 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.27□□□□□ -2.37
NPRL3Q12980 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NPRL3Q12980 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NPRL3Q12980 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NPRL3Q12980 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NPRL3Q12980 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NPRL3Q12980 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NPRL3Q12980 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NPRL3Q12980 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NPRL3Q12980 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NPRL3Q12980 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NPRL3Q12980 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NPRL3Q12980 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NPRL3Q12980 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NPRL3Q12980 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NPRL3Q12980 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NPRL3Q12980 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NPRL3Q12980 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NPRL3Q12980 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NPRL3Q12980 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
NPRL3Q12980 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NPRL3Q12980 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NPRL3Q12980 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NPRL3Q12980 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NPRL3Q12980 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NPRL3Q12980 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NPRL3Q12980 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NPRL3Q12980 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NPRL3Q12980 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NPRL3Q12980 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NPRL3Q12980 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NPRL3Q12980 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NPRL3Q12980 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NPRL3Q12980 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NPRL3Q12980 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NPRL3Q12980 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NPRL3Q12980 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NPRL3Q12980 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NPRL3Q12980 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 219.6 ms