Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SCN11AQ9UI33 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SCN11AQ9UI33 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SCN11AQ9UI33 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC-2.23□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC-2.23□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC-2.24□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC-2.24□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC-2.25□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC-2.27□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.78
SCN11AQ9UI33 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.78
SCN11AQ9UI33 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.78
SCN11AQ9UI33 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.78
SCN11AQ9UI33 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.78
SCN11AQ9UI33 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.78
SCN11AQ9UI33 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.78
SCN11AQ9UI33 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.78
SCN11AQ9UI33 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.78
SCN11AQ9UI33 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SCN11AQ9UI33 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SCN11AQ9UI33 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SCN11AQ9UI33 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SCN11AQ9UI33 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SCN11AQ9UI33 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SCN11AQ9UI33 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SCN11AQ9UI33 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SCN11AQ9UI33 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SCN11AQ9UI33 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SCN11AQ9UI33 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SCN11AQ9UI33 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SCN11AQ9UI33 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SCN11AQ9UI33 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SCN11AQ9UI33 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SCN11AQ9UI33 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SCN11AQ9UI33 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SCN11AQ9UI33 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SCN11AQ9UI33 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SCN11AQ9UI33 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SCN11AQ9UI33 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SCN11AQ9UI33 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
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