Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU0

FLRT3, Leucine-rich repeat transmembrane protein FLRT3, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLRT3Q9NZU0 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
FLRT3Q9NZU0 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
FLRT3Q9NZU0 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
FLRT3Q9NZU0 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
FLRT3Q9NZU0 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
FLRT3Q9NZU0 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
FLRT3Q9NZU0 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
FLRT3Q9NZU0 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
FLRT3Q9NZU0 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
FLRT3Q9NZU0 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
FLRT3Q9NZU0 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
FLRT3Q9NZU0 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
FLRT3Q9NZU0 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
FLRT3Q9NZU0 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
FLRT3Q9NZU0 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
FLRT3Q9NZU0 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
FLRT3Q9NZU0 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
FLRT3Q9NZU0 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
FLRT3Q9NZU0 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
FLRT3Q9NZU0 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
FLRT3Q9NZU0 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
FLRT3Q9NZU0 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
FLRT3Q9NZU0 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
FLRT3Q9NZU0 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
FLRT3Q9NZU0 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
FLRT3Q9NZU0 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
FLRT3Q9NZU0 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
FLRT3Q9NZU0 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
FLRT3Q9NZU0 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
FLRT3Q9NZU0 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
FLRT3Q9NZU0 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
FLRT3Q9NZU0 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
FLRT3Q9NZU0 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
FLRT3Q9NZU0 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
FLRT3Q9NZU0 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
FLRT3Q9NZU0 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
FLRT3Q9NZU0 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
FLRT3Q9NZU0 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
FLRT3Q9NZU0 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
FLRT3Q9NZU0 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
FLRT3Q9NZU0 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
FLRT3Q9NZU0 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
FLRT3Q9NZU0 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
FLRT3Q9NZU0 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
FLRT3Q9NZU0 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.2 ms