Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SMC1AQ14683 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
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