Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
COL9A2Q14055 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC2□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC2□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC2□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC2□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC2□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
COL9A2Q14055 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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