Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNGB1Q14028 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNGB1Q14028 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNGB1Q14028 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNGB1Q14028 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNGB1Q14028 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNGB1Q14028 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNGB1Q14028 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNGB1Q14028 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNGB1Q14028 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNGB1Q14028 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNGB1Q14028 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNGB1Q14028 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNGB1Q14028 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNGB1Q14028 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNGB1Q14028 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CNGB1Q14028 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CNGB1Q14028 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CNGB1Q14028 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CNGB1Q14028 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CNGB1Q14028 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CNGB1Q14028 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CNGB1Q14028 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CNGB1Q14028 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CNGB1Q14028 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CNGB1Q14028 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CNGB1Q14028 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CNGB1Q14028 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CNGB1Q14028 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CNGB1Q14028 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CNGB1Q14028 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.09
CNGB1Q14028 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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