Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HDAC1Q13547 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.21
HDAC1Q13547 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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