Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
MKRN4PQ13434 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
MKRN4PQ13434 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 251.4 ms