Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FOXD4Q12950 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
FOXD4Q12950 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
FOXD4Q12950 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
FOXD4Q12950 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
FOXD4Q12950 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
FOXD4Q12950 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
FOXD4Q12950 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
FOXD4Q12950 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
FOXD4Q12950 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
FOXD4Q12950 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
FOXD4Q12950 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
FOXD4Q12950 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXD4Q12950 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXD4Q12950 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXD4Q12950 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXD4Q12950 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXD4Q12950 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXD4Q12950 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXD4Q12950 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXD4Q12950 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXD4Q12950 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXD4Q12950 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXD4Q12950 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FOXD4Q12950 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FOXD4Q12950 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FOXD4Q12950 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FOXD4Q12950 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FOXD4Q12950 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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