Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRCP08575 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRCP08575 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRCP08575 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRCP08575 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRCP08575 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRCP08575 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRCP08575 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRCP08575 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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PTPRCP08575 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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PTPRCP08575 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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PTPRCP08575 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
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PTPRCP08575 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRCP08575 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRCP08575 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRCP08575 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRCP08575 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRCP08575 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRCP08575 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRCP08575 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRCP08575 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRCP08575 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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