Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CGGBP1Q9UFW8 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CGGBP1Q9UFW8 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CGGBP1Q9UFW8 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CGGBP1Q9UFW8 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CGGBP1Q9UFW8 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CGGBP1Q9UFW8 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CGGBP1Q9UFW8 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CGGBP1Q9UFW8 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CGGBP1Q9UFW8 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CGGBP1Q9UFW8 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CGGBP1Q9UFW8 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CGGBP1Q9UFW8 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CGGBP1Q9UFW8 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CGGBP1Q9UFW8 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CGGBP1Q9UFW8 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CGGBP1Q9UFW8 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CGGBP1Q9UFW8 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CGGBP1Q9UFW8 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CGGBP1Q9UFW8 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CGGBP1Q9UFW8 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CGGBP1Q9UFW8 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CGGBP1Q9UFW8 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CGGBP1Q9UFW8 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CGGBP1Q9UFW8 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CGGBP1Q9UFW8 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
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