Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF239Q16600 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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