Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
KARSQ15046 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
KARSQ15046 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
KARSQ15046 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
KARSQ15046 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
KARSQ15046 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
KARSQ15046 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
KARSQ15046 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
KARSQ15046 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
KARSQ15046 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
KARSQ15046 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
KARSQ15046 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
KARSQ15046 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
KARSQ15046 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
KARSQ15046 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
KARSQ15046 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
KARSQ15046 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
KARSQ15046 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
KARSQ15046 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
KARSQ15046 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
KARSQ15046 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
KARSQ15046 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
KARSQ15046 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
KARSQ15046 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
KARSQ15046 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
KARSQ15046 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
KARSQ15046 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
KARSQ15046 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
KARSQ15046 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
KARSQ15046 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
KARSQ15046 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
KARSQ15046 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
KARSQ15046 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
KARSQ15046 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
KARSQ15046 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KARSQ15046 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KARSQ15046 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KARSQ15046 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KARSQ15046 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KARSQ15046 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KARSQ15046 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KARSQ15046 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KARSQ15046 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KARSQ15046 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
KARSQ15046 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KARSQ15046 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KARSQ15046 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KARSQ15046 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
KARSQ15046 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KARSQ15046 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KARSQ15046 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KARSQ15046 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KARSQ15046 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KARSQ15046 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KARSQ15046 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
KARSQ15046 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KARSQ15046 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
KARSQ15046 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KARSQ15046 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
KARSQ15046 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KARSQ15046 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KARSQ15046 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KARSQ15046 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KARSQ15046 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KARSQ15046 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KARSQ15046 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KARSQ15046 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KARSQ15046 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KARSQ15046 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KARSQ15046 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KARSQ15046 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KARSQ15046 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KARSQ15046 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KARSQ15046 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KARSQ15046 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KARSQ15046 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KARSQ15046 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KARSQ15046 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KARSQ15046 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KARSQ15046 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KARSQ15046 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KARSQ15046 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KARSQ15046 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KARSQ15046 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KARSQ15046 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KARSQ15046 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KARSQ15046 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KARSQ15046 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KARSQ15046 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KARSQ15046 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KARSQ15046 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KARSQ15046 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KARSQ15046 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KARSQ15046 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KARSQ15046 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KARSQ15046 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KARSQ15046 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
KARSQ15046 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
KARSQ15046 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
KARSQ15046 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
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