Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN5AQ14524 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
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